在所有真核细胞中,基因表达分三步进行,分别由RNA聚合酶(RNA polymerase)、剪接体(Spliceosome)、和核糖体(Ribosome)执行。首先,储存在遗传物质DNA序列中的遗传信息必须通过RNA聚合酶的作用转变成前体信使RNA (precursor messenger RNA, 简称pre-mRNA),这一步简称转录(transcription);其次,前体信使RNA由多个内含子和外显子间隔形成,必须通过剪接体的作用去除内含子、连接外显子之后才能转变为成熟的信使RNA,这一步简称剪接(splicing);第三,成熟的信使RNA必须通过核糖体的作用转变成蛋白质之后才能行使生命活动的各种功能。描述这一过程的规律被称为生物学的中心法则,其在生命科学领域具有核心重要性。但是,现在Nature 背靠背发表3篇文章,揭示剪接过程的异常,会导致肿瘤的发生。癌症是由称为驱动因子的基因组改变引起的。尽管已知有数百种编码基因的驱动程序,虽然进行了深入的已经,但迄今为止仅发现了少数非编码驱动程序。相比之下,由于表征非编码癌症驱动程序的综合挑战和snRNA基因的重复性,对剪接体非编码成分,一系列小核RNA(snRNA)的癌症相关改变的研究很少。2019年10月9日,Lincoln D. Stein团队在Nature 在线发表题为'The U1 spliceosomal RNA is recurrently mutated in multiple cancers'的研究论文,该研究报告了在几种肿瘤类型中,U1 snRNA的第三个碱基处高度复发的A C体细胞突变。U1的主要功能是通过碱基配对识别5'剪接位点(5'SS)。此突变将U1和5'SS之间的优先A-U碱基配对更改为C-G碱基配对,从而创建新的剪接点并改变了多个基因的剪接模式,包括已知的癌症驱动程序。在临床...
发布时间: 2019 - 10 - 13
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在所有真核细胞中,基因表达分三步进行,分别由RNA聚合酶(RNA polymerase)、剪接体(Spliceosome)、和核糖体(Ribosome)执行。首先,储存在遗传物质DNA序列中的遗传信息必须通过RNA聚合酶的作用转变成前体信使RNA (precursor messenger RNA, 简称pre-mRNA),这一步简称转录(transcription);其次,前体信使RNA由多个内含子和外显子间隔形成,必须通过剪接体的作用去除内含子、连接外显子之后才能转变为成熟的信使RNA,这一步简称剪接(splicing);第三,成熟的信使RNA必须通过核糖体的作用转变成蛋白质之后才能行使生命活动的各种功能。描述这一过程的规律被称为生物学的中心法则,其在生命科学领域具有核心重要性。但是,现在Nature 背靠背发表3篇文章,揭示剪接过程的异常,会导致肿瘤的发生。癌症是由称为驱动因子的基因组改变引起的。尽管已知有数百种编码基因的驱动程序,虽然进行了深入的已经,但迄今为止仅发现了少数非编码驱动程序。相比之下,由于表征非编码癌症驱动程序的综合挑战和snRNA基因的重复性,对剪接体非编码成分,一系列小核RNA(snRNA)的癌症相关改变的研究很少。2019年10月9日,Lincoln D. Stein团队在Nature 在线发表题为'The U1 spliceosoma...
发布时间: 2019 - 10 - 13
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本文转载自:生物探索成年人的世界没有容易两个字,生活中的压力也接踵而来,科研压力、学业压力、生活压力就像一张无形的大网将我们紧紧包围。适当的压力能够激发潜能,但是压力太大容易带来各种健康问题。近日,《Nature》杂志接连发表了两项研究证明:压力大不仅会削弱细胞防御机制还能抑制免疫应答。吓得小编立马瘫在座位上调节起情绪来。当人们感到有压力或是感知到危险时,身体会释放出肾上腺素等压力荷尔蒙。肾上腺素会让心脏跳动得更快,促进大脑和肌肉中的血液流动,进而刺激身体燃烧糖分、脂肪。此时人体处在一种随时“战斗”的状态中。来自马萨诸塞大学医学院神经生物学教授Mark Alkema博士的实验室研究揭示:长期处于这种“战斗”状态会损害机体健康。DOI: 10.1038/s41586-019-1524-5Mark Alkema博士的研究团队将秀丽隐杆线虫作为研究模型。研究人员通过刺激线虫体内一对释放酪胺的神经元控制线虫的飞行反应。在像线虫这一类的无脊椎动物体内,酪胺类似于人体内的肾上腺素。在面对突如其来的高温或食物短缺等生存压力时,线虫体内酪胺的释放量明显减少。研究结果表明:酪胺激活了胰岛素通路后满足动物对飞行反应的能量需求。但另一方面,胰岛素通路的下调才有助于保护细胞免受环境压力,延长寿命。线虫的应激反应机制为研究压力对人类健康和衰老有着启发性的意义。从激活胰岛素途径来看,当人们面对压力时,激素变化...
发布时间: 2019 - 09 - 29
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今日,三篇重磅研究登上了Nature封面。这三项研究,全都指向了同一个内容——肿瘤和神经的相互作用。其中,洛桑联邦理工学院的Qiqun Zeng和Douglas Hanahan等研究发现,大脑中的神经细胞会帮着乳腺癌在脑中生长。乳腺癌细胞在脑中与神经元形成三方突触,利用突触间的神经递质谷氨酸促进自己的定植和生长。而在来自海德堡大学[2]的研究中,研究人员也发现大脑中的神经元会跟胶质瘤细胞形成谷氨酸能突触,促进肿瘤侵袭生长。斯坦福大学[3]的研究人员则发现,胶质瘤还会利用神经元活动产生的钾电流,激活自己,促进自己生长。都说肿瘤不可怕,肿瘤转移才可怕,而最可怕的恐怕就是脑转移了。毕竟颅骨这个近乎密闭的壳里,空间十分有限,肿瘤长在哪都会挤到十分重要的脑组织。而原本保护大脑的血脑屏障,此时也成了治疗的阻碍,许多抗癌药物都会被拦截在大脑外面,无法到前线杀敌。而种种肿瘤中,乳腺癌可以说是很爱脑转移的一个了,是女性肿瘤脑转移的主要原因之一。据统计,大约5%的乳腺癌患者会发生脑转移[4]。著名歌手姚贝娜,就是死于乳腺癌的脑转移。脑转移的乳腺癌可不仅仅是换了个地方这么简单,有研究显示转移到脑子中的乳腺癌细胞,会被大脑中的微环境诱导着重编程,在发育过程中模拟神经发生的过程[5,6]。其中,那些跟神经信号通路有关的基因,在脑转移的乳腺癌中上调的十分明显,比如谷氨酸受体。此前在胰腺神经内分泌瘤中,就曾经发...
发布时间: 2019 - 09 - 27
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本文转载自:生物探索代表通用dCas9系统(顶部)和Cascade系统(底部)的组件的插图:Gersbach Lab2类CRISPR–Cas系统,例如Cas9和Cas12,已被广泛用于靶向真核基因组中的DNA序列。但是,代表自然界中所有CRISPR系统90%的1类CRISPR-Cas系统在基因组工程应用中仍未开发。杜克大学(Duke University)的生物医学工程师利用此前未被探索的CRISPR技术,精确地调控和编辑人类细胞中的基因组。通过这种新方法,研究人员希望能极大地扩展基于CRISPR的生物医学工程师可用工具,为基因组工程技术开辟一个新的、多样化的前沿。该项研究发表在9月23日的《Nature Biotechnology》杂志上。杜克大学鲁尼家族生物医学工程副教授Charles Gersbach和格斯巴赫实验室的博士后研究员Adrian Oliver是该项研究的领导者。https://doi.org/10.1038/s41587-019-0235-7CRISPR-Cas是一种防御系统,其中细菌利用RNA分子和CRISPR相关(Cas)蛋白靶向并破坏入侵病毒的DNA。这一现象的发现和分子机制的重新定位引发了一场基因组编辑革命,因为研究人员学会了如何利用这一工具专门针对和编辑人类细胞中的DNA。CRISPR-Cas9是当今最常用的基因组编辑工具,并被归类为2类CRISPR系...
发布时间: 2019 - 09 - 27
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细胞是生物体结构和功能的基本单位,而在你我体内,每时每刻却有成千上万的细胞死去,或是由于细胞病变,或是为了控制细胞数目,维持组织更替。比如,人体内小肠上皮细胞每 2-3 天就会更新一次,以维持正常的肠道功能。这些死去细胞的碎片通常会被来自免疫系统的吞噬细胞(phagocytes) 迅速清除,以确保机体微环境的稳定,避免发生炎症反应。细胞死亡不仅仅发生在成熟的个体中。脊椎动物胚胎在生长发育产生大量新细胞的过程中,为了调整形态发生、控制组织大小、剔除不健康的细胞,也有数不清的细胞被判死刑。最为夸张的是在神经系统发生时,早期神经干细胞分化分裂出 2 倍之余所需的神经细胞和胶质细胞,在之后的细胞分化和神经网络搭建过程中,多余的细胞全部会死去,产生大量的细胞碎片。然而,在早期胚胎发育阶段,负责清除死细胞的免疫系统还没完全成熟,与此同时,神经系统早已迫不及待地开始搭建。那么,究竟是什么机制确保了早期胚胎中的死细胞能被迅速清除呢?发育生物学家们被这个问题困扰多年。2019 年 9 月 5 日,弗吉尼亚大学 Sarah Kucenas 实验室在 Cell 杂志发表了题为Migratory Neural Crest Cells Phagocytose Dead Cells in the Developing Nervous Sys...
发布时间: 2019 - 09 - 09
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动物胚胎如何由一个均一的卵裂球发育为具有头尾、背腹和左右等不对称特征的胚胎,是发育生物学中一个重要的研究领域。为纪念创刊125周年,Science 杂志于2005年7月提出了125个重要的科学问题。上述胚胎不对称性建立的机制,即属于其中的科学问题之一。左右不对称(left-right asymmetry)在自然界中很常见的。例如,招潮蟹左右分别有一个大的和一个小的蟹钳,而比目鱼总是身体一侧躺在海底。大多数脊椎动物虽然从外表看上去是左右对称的,但心脏在发育过程中是不对称环化的,并且最终定位在胸腔左侧;左右肺也是由不同数目的肺叶组成的。在腹腔中,胃和胰腺位于左侧,肝脏位于右侧,而且肠道也是不对称卷曲的(图1)【1】。有意思的是,我们人类的脑部也表现出从结构和功能上的左右不对称性。在胚胎发育过程中,左右不对称缺陷有可能带来严重的后果。内脏异位 (Heterotaxy) 是一类以随机的内脏左右分布为特征的遗传疾病,发病率在1:10000作用。先天性心脏病的发病几率在内脏异位的病人中大大增加,尤其是大动脉的移位及室间隔的缺陷尤为常见【2,3】。图1. 人体内部的左右不对称性。目前,对于胚胎左右不对称发育的机制已经有了初步的了解。起初,胚胎沿体轴中线进行左右对称性发育。在体节期,脊索最末端出现了一个小的凹陷。组成这个凹陷的细胞均具有纤毛。这些纤毛有规律的摆动,使得...
发布时间: 2019 - 08 - 26
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斑马鱼品系的命名规则近年来我国的斑马鱼研究发展迅速。2018年,我国斑马鱼相关研究论文在国际论文中占比已超过26%。中国成为仅次于美国的第二大斑马鱼研究大国。随着研究工作的蓬勃发展,我国实验室构建和保存的斑马鱼突变品系、转基因品系数量也越来越多。为方便同行分享、优化资源、避免重复,斑马鱼的规范命名工作势在必行。本文在此简要介绍斑马鱼品系的命名规则。首先,机构在为新创制的斑马鱼品系申请命名前,需先申请确定一个“机构命名代码”。在过去,斑马鱼品系是以实验室为命名单位。但近年来由于斑马鱼实验室数量激增,新的命名规则改为采用以实验室所属机构为命名单位。注意:同属一家机构的实验室应当共同协商、共同确认机构命名代码。机构命名代码:三个符合1. 首选2个字母的名称;其次再考虑3个字母的名称。2. 不得与任何斑马鱼、人类或小鼠基因名称或表型名称相冲突。3. 不得与其他已有的认机构命名代码冲突。例如,“t”已被注册为Tubingen的代码,但以“t”开头的大多数2个字母组合名称仍可使用。斑马鱼品系的命名:五个规则1. 每个等位基因的命名必须是唯一的。由于每个机构都有不同的机构命名代码,因此所有品系都是唯一标识的。检索ZFIN网站的代码清单表格可以查找全部已有的机构命名代码。2. 命名若以d开头则表示该突变为显性突变;否则为隐性突变。因此,d不能作为任...
发布时间: 2019 - 08 - 16
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你是否能想到你的肠道也有特殊的主动技能来抵御对你有害的物质。8月7日发表在《美国国家科学院院刊(PNAS)》上的一项研究,来自美国杜克大学的研究团队发现,斑马鱼肠道内的细胞(可能也包括人类)在面对某些毒素时会使用一种不同寻常的防御机制—— “按下弹出键”,排出有害物质。杜克大学的研究生Ted Espenschied说:“肠道的工作非常具有挑战性,它需要处理我们摄入或产生的各种化学物质,而其中有些是具有破坏性的。因此,它已经进化出许多抵御这些破坏作用的有趣方法。”这项研究是Espenschied毕业论文的一部分。该研究团队测试了超过20种非甾体抗炎药(NSAID),试图将斑马鱼作为研究肠道化学损伤的新模型。这种鱼的饲养成本很低且易于繁殖,最重要的是,它们在生命早期是半透明的,很容易通过罐水进行化学品接触和测量其环境条件。在这项研究中,研究人员发现了一些意外事件。杜克大学微生物中心主任、分子遗传学和微生物学助理教授John Rawls说:“通常情况下,药物会产生多种脱靶效应。” 但在他们测试的药物中,似乎只有一种名为Glafenine的非甾体抗炎药给斑马鱼带来了可测量的差异。三十年来,它一直是欧洲和中东地区使用的一种非处方口服止痛药,但在发现与肾脏和肝脏损伤有关后被下架。Glafenine通过一种叫做“剥离(delamination)”的过程使斑马鱼在一夜之间脱落了多达四分之一的肠上皮...
发布时间: 2019 - 08 - 12
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“第14届国际斑马鱼大会”于2019年6月12-16日在苏州国际博览中心举办。“国际斑马鱼大会”是全球斑马鱼研究领域最具影响力和最权威的系列学术会议,自 1994 年开始一直在美国举办,目前已经举办了13届。为了加强斑马鱼研究的国际合作和推动斑马鱼研究在中国和亚太地区的发展,经多方努力,“第14届国际斑马鱼大会”首次在美国以外的地区(中国苏州)举行。本届大会由国际斑马鱼协会主办,苏州大学和中国动物学会斑马鱼分会承办,大会吸引了上千名来自中国与全球各地的斑马鱼研究人员和专家共同学习探讨。大会开幕式与12日17点在苏州大学特聘教授王晗、清华大学教授孟安明和国际斑马鱼协会会长Mary Mullins的主持下召开。会议沿袭往届美国麦迪逊以及欧洲斑马鱼大会的传统,形式多种多样。会议在开幕式前开设了职业发展工作坊,让从事斑马鱼研究的学生们能在一个更宽松、亲密的氛围中学习并与老师们进行交流。在全体大会报告上,嘉宾们介绍了在斑马鱼的早期发育、行为分析、基因组学、基因编辑等领域的最新进展和研究成果,并与观众积极互动,现场解答观众提问。会议着重强调年轻科研人员的发展,除了常规的全体大会报告、主题演讲、分会场技术讲座等以外,会议还颁发了斑马鱼研究界久负盛名的钱其斌奖、George Streisinger奖、以诺贝尔得主命名的克里斯汀·纽斯林-沃尔哈德奖以及中国斑马鱼协会蔡司青年研究员四个奖项并...
发布时间: 2019 - 06 - 17
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2019年1月13日下午15时,由南京歆佳医药科技有限公司主办的首届斑马鱼模型与基础、临床应用学术沙龙在定淮门大街99号1楼多功能厅成功开展。图中为各研究生、导师及公司员工合影       沙龙邀请了十余位医学领域的专家教授,以及他们所指导的研究生。由南京歆佳医药科技有限公司董事长潘忠军致开幕词。图中为潘忠军董事长致开幕词       沙龙上分别由解放军东部战区总医院罗静博士后,南京医科大学研究生王天俊博士、中科院神经所博士兼南京歆佳医药科技有限公司技术总监顾珊烨进行了汇报交流。       罗静博士后对LncRNA与肿瘤物质代谢及免疫逃逸的机制研究进行了汇报交流。他从肿瘤细胞的脂质代谢、糖酵解过程等方面对肿瘤细胞的新陈代谢过程进行了分析,并对国际上现有的一些研究方向和方法进行了总结。图中为罗静博士后正在进行汇报       王天俊博士对IncRNA00622调控滋养层细胞中的相关因子影响子宫螺旋动脉血管内皮细胞形成的机制研究进行了汇报。他利用斑马鱼模型观测细胞的增殖和侵袭情况,对其进行定性研究,总结了调控及影响子宫螺旋动脉血管内皮细胞...
发布时间: 2019 - 01 - 16
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2018年11月6日上午,为防范灾害,加强火灾防范意识,南京歆佳医药科技有限公司展开了全公司消防安全知识培训,并于现场对实际发生火灾情况进行了演习。
发布时间: 2018 - 11 - 08
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2018年10月12日,第四届全国斑马鱼PI大会于武汉召开,南京歆佳医药科技有限公司以大会“白金级赞助商”身份在大会上进行了“基因编辑与肿瘤模型研发与技术服务”为主题的汇报,技术总监顾珊烨就现有基因编辑技术和细胞移植技术进行了总结,并对斑马鱼在各种发育性疾病中作为模式动物的优势进行了汇报,之后还对斑马鱼的应用前景展开了进一步的阐述。
发布时间: 2018 - 11 - 02
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